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蘇州辦理第二類醫療器械備案的流程及費用如下：

簽署合同：申請人簽署合同后，支付預付款。公司查名：申請人需提供公司相關證件材料，在當地工商部門進行查名。準備材料：申請人需按照要求準備好相關證件材料，并遞交到當地藥監局進行審批。遞交申請材料：申請人將填好的申請表和相關證件材料一并遞交到當地藥監局，并領取受理通知書。

通過藥檢局檢查：申請人的申請材料將由藥監局進行審批，如果審批通過，將會獲得《醫療器械經營許可證》。注冊資金到位：如果申請人的公司是屬于有限責任公司的類型，則需要出具驗資報告，并將注冊資金繳納到指定的賬戶上。獲得營業執照：如果申請人的審批通過，將會領取到營業執照。獲得組織機構代碼證：如果申請人的公司已經辦理了營業執照，還需要去相關機構申請辦理組織機構代碼證。獲得稅務登記證：如果申請人的公司已經辦理了營業執照和組織機構代碼證，還需要前往當地稅務局申請辦理稅務登記證。交付材料、支付余款：*后，申請人需要將申請材料交付給藥監局，并支付應繳納的費用，才能完成整個二類醫療器械備案流程。

以上就是蘇州辦理第二類醫療器械備案的整個流程，具體所需費用要根據所在地區的不同而有所差異。建議您在辦理前先咨詢相關部門，了解詳具體的費用和流程。