深圳出口加工區的功能十分強大，說出口加工區的功能跟香港的功能一樣，的區別就是在中國境內的區域，它是由海關監管的區域。貨物進入保稅區視同出口，出去保稅區回到國內視同進口。

1、一般企業銷售產品給加貿企業要用“間接轉廠”，就是供應商把產品出口到保稅區，加貿企業再用加貿手冊從保稅區報關進口。這可以完全解決一般制造企業與加貿企業的轉廠問題。加貿企業進口是保稅的，而供應商出口后可以向稅務局申請出口退稅。

2、同是加工貿易的兩家工廠，因為隸屬的主管海關不一樣、手冊備案的貨物信息有差異，通過保稅區操作，實現轉廠交貨的目的。雙方工廠分別拿手冊資料到保稅區海關報關出口或進口，載貨車輛入區不需卸貨，當天即可出區通關進口，實現“一日游”操作（實際只需3個小時左右）。

3、加貿工廠供貨給一般工廠，即出口轉內銷，也是“轉廠”模式：加貿工廠將貨物以手冊保稅核銷方式出口到保稅區(深圳出口加工區)，一般工廠則以一般貿易方式征稅進口國內。 

二、為什么只有深圳出口加工區可以做轉廠

加工貿易企業A用保稅進口的原材料生產的成品半成品，為了手冊核銷是必須要出口到國外的。由于保稅區具有“境內關外”政策，加貿企業可以出口至保稅區。

一般貿易企業B長期以來都在尋找海外供應商，當然若有國內外資供應商是的，正好可利用保稅區進行轉廠來實現交易目的，一般貿易企業按照正常征稅進口就可以了。

同樣的，作為主要以出口為主的國內一般貿易企業，所生產的成品。可以出口到保稅區，加工貿易企業可以向主管海關申請手冊備案即可。節省出口的海運費用和時間。而一般貿易企業出口至保稅區可以申請出口退稅。

1、出口加工區轉廠無需海關監管車，無需裝卸貨，無需入倉庫，入區既能退稅；

2、產品備案通過就可以轉廠，通關速度提高；

3、車輛入區兜圈，無需經過香港；

4、入區既能退稅，無需經過香港即可退稅；

5、產品出口到保稅區就可以核銷手冊。

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