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IP蛋白磷酸化位點質譜鑒定就是指利用質譜技術對免疫沉淀下來的蛋白質進行磷酸化位點鑒定。免疫沉淀技術是分析蛋白質相互作用的常用技術，其利用抗原與抗體特異性結合的原理來尋找與目的蛋白相互作用的靶蛋白。IP獲得的靶蛋白可以通過質譜技術后續分析，即IP-MS分析，主要是對其進行定性和定量鑒定，表征其翻譯后修飾情況。

利用IP-MS鑒定蛋白磷酸化位點要通過IP獲得靶蛋白，將靶蛋白進行多重酶切，再將富集的磷酸化肽段進行液相色譜串聯質譜分析，由于磷酸化的肽段相比沒有磷酸化的肽段分子質量剛好增加了一個磷酸基團的值，根據肽段質譜數據對肽段的分子質量進行分析可以實現靶蛋白的磷酸化位點鑒定。

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百泰派克生物科技-生物藥物表征，生物質譜多組學優質服務商
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